解放前的上海，国内既无勘察队伍，也无勘察机构。1945年抗战胜利后，私人经营的"建筑事务所"，仅能搞些一般性的勘察设计，较大的勘察工程均由外国承包。
上海的勘察队伍，是在新中国成立后随着国民经济的迅速恢复和工程建设项目的投资建设应运而生的
上海岩土工程勘察设计研究院的发展史，大致可以分为四个阶段。（第一阶段、第二阶段、第三阶段、第四阶段）
第一阶段，1958年至1977年底
1950年5月，华东工业部在沪成立建筑设计公司，下设的"土木室"内开始组建一支约有30人的勘察队伍，掀开了上海勘察史的第一页。同年11月，这支勘察队伍从"土木室"分出，成为建筑设计公司的直属"土测队"，1953年改名"勘察室"。1954年1月，建筑设计公司划归中央建筑工程部领导，更名为"上海市城市建筑设计院"，当时已有百名左右职工的勘察室一分为二，分别成为院属的土壤室和测量室。1957年4月，国家建工部决定将上海建筑设计院的勘察队伍划出，单独成立"上海勘察站"，直属国家建工部综合勘察院领导。这就是后来广为同行业熟悉的上海勘察院的前身。
1958年，为适应上海和华东地区基建勘察任务发展的需要，经建工部批准正式成立"建工部综合勘察院华东分院"，将城建系统的部分勘察力量充实"上海勘察站"，上海勘察院正式宣告成立，院部机关设在延安东路34号。在成立的当年，全年共完成勘察任务134项，技术革新200项，经评定，其中39项接近或达到国内外先进水平，职工总数达到约200人，到1959年底，职工迅速发展到600多名。
成立之初，勘察院下设工程地质、水文地质和测量队三个专业生产队，主要承担华东六省一市的水文调查、凿井和工程勘察等任务。1959年接受了江西城市设计院测量室第二大队的60多名测量人员，充实了专业技术力量，组织机构调整为测量队、工程地质队和水源队。1959年5月，党的组织关系由中共上海市设计科学研究委员会领导改为中共上海市基本建设设计委员会领导。当时围绕优质高产，普遍开展以"比思想、比产量、比质量、比节约、比安全、比协作"为内容的红旗竞赛运动，增产节支，掀起生产高潮。1960年底，测量完成9159平方公里，动力钻探完成近40000标准米，凿井56眼，生产有大幅度的提高。1961年，根据国家建工部的决定成立"建工部非金属矿地质公司直属华东大队"，集中优势兵力上山寻找新矿点，尤其是加强水晶、金刚石、冰洲石等特种（贵重）非金属矿的矿点检查。同时，勘察院的原一队、三队的部分勘察人员划归华东工业建筑设计院（今华东建筑设计院有限公司前身）领导，成为其下的勘察室。8月，该勘察室136人又归回非金属地质公司直属华东大队领导，编制不变，下设技术、行政管理组、内业组和三各外业组。1962年初，根据《工业十七条》，指定"五定"、"五保"方案和全面推行"定保奖"办法，开展以"定、保、奖"为中心的劳动竞赛运动。1964年3月，根据国家经济委员会决定，重建建工部综合勘察院，并将非金属地质公司华东分公司的一部分力量划分出来，重新恢复由综合勘察院领导的华东分院。
在该阶段，勘察院完成不少国家重点项目，如1973年"上海卫星地面站30米天线基础"勘察（获1978年国家重大科技奖），1973年完成的国家重点工程金山石化总厂的油罐区勘察；在技术革新方面，自行设计制造了跃进HC-30型工程地质钻机、HRV-60B型全液压程序控制工程地质钻机（获全国科学大会奖）、"油压拧锚机"等。在这一阶段，由于历经"三反"、"五反"等政治运动和十年"文革"的劫难，国家经济建设受到严重影响，一度停顿不前，再加当时国家尚属短缺经济阶段，在计划经济体制下，为工程建设进行勘察是指令性任务，不收取任何营业性费用，勘察生产和技术虽然在建国后相当一段时间内有较大的发展，但是随着形势发展和经济建设局面的开创，这种用事业体制来办勘察的做法的低效率越来越不适应经济建设的需要。
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第二阶段，1978年至1991年底
以十一届三中全会的胜利召开为标志，党和国家实现以经济建设为中心的战略转移，上海勘察院迎来了新的发展历史时期。在这一阶段，勘察事业随着国家重大建设工程的上马，勘察院取得很快发展。1980年1月，经上海市计委、建委和财政局批准，上勘院列为事业单位企业化试点单位，开始试行技术经济责任制，原事业费开支改为按完成任务多少收取勘察费，自负盈亏，执行企业财务制度，享受劳保福利和奖励制度，并逐步建立和完善勘察技术经济承包经营责任制施行办法，打破"大锅饭"，通过改革强化管理，增强活力，改善服务，提高效益。
为适应市场竞争，信守合同，开展全体职工的《全面质量管理》教育。率先在美国投资的上海环球联碳分子有限公司2500吨/年分子筛装置工程中成立QC小组，实行全面质量管理，以创优为目标，对工序质量、服务态度和工程进度实行中间检查。施行全面质量管理对提高工程质量，改进服务，树立单位信誉，提高竞争力发挥了积极的作用。
在此期间，我院的科研工作也取得较快的发展。1981年，HRV-60型全液压程序控制工程地质钻机以及YLC-10型全液压连续贯入程序控制静力触探车，通过国家建委鉴定。由我院自行设计研制的SG-15型双缸静力触探机在1983年上海市技术革新成果展览会和1984年全国建筑科技成果交流会上获优秀项目奖。1984年，适应高层建筑多、难度大的基建趋势，院加强科研攻关，突破深层取土，落实高压试验设备以及加强企业管理等措施。1985年12月，开拓岩土工程专业并设置业务机构，并于第二年年初开展有关工程技术的试验和研究，通过实践、研究，逐步向纵深发展，逐渐开拓了树根桩、石灰桩、挤密碎石桩等地基处理办法和施工工艺，开展了砼灌注桩、桩的静载荷试验、动测和施工监测业务，在大口径超深曝气井方面承担不少项目，对基本建设提高社会和经济效益起了一定的作用。1986年7月，经上级主管部门核准，成立咨询部，主营各类勘察，地基加固处理与效果检测，施工监理，工程勘察机具研制，微机软件等方面的科技咨询，至1990年，取得较明显的社会和经济效益。
此阶段，我院在对外经济技术合作和学术交流互访开始活跃，先后与美国、日本、西德、意大利、新加坡、俄罗斯、伊拉克、阿尔巴尼亚和香港等国家和地区开展交流与合作，社会影响日益扩大。1978年6月，在建工部全国建工系统科技工作会议上，"全国建工勘察科技情报网"宣告成立，我院成为华东地区情报网的站长单位，负责联系、组织126个成员单位的科技情报、学术交流等工作。1980年2月，铜陵矿区38名职工支援我院，行政关系保持不变，后在1983年9月经市规划局批准，正式转入我院。1981年，经上海市建委批准，我院获得上海市第一批《勘察证书》。1987年4月，获国家城乡建设环境保护部审核，批准我院为甲级勘察单位，并颁发《工程勘察证书》，同年，经北京中建公司批准，我院测量人员出国支援伊拉克工程建设。1988年10月，迎来建院30周年，全国人大委员长万里和时任上海市副市长的倪天增分别发来贺信。1991年被评为建设部优秀勘测单位。
在此阶段，我院先后完成一大批国家和上海市的重点工程。如1978年1月，继1977年11月完成对宝钢项目上马可行性勘察的6个百米钻孔后，我院完成了上海宝钢近10平方公里的近百个钻孔的选址勘察任务，4月，完成总厂初步设计阶段的工程地质勘察，所取得的完整的地质数据，在谈判中日方代表表示满意和放心。
1979年5月，根据中央和市委关于重建唐山的指示，勘察院调出两个钻探班赴唐山地震灾区参加重建唐山的大会战，工人、技术人员急唐山人民所急，艰苦奋战，工效很高，为恢复唐山的经济作出了积极贡献。
1980年，承接并完成了金山石化总厂"芳烃联合装置"工区寻找隐伏爆炸物的探测，探测面积7000多平方米，复测面积近15000平方米，查找并挖出区内埋藏的炮弹、炸弹30多吨，排除了安全隐患，确保了打桩工程的顺利进行。该项目分获1986年建工部和上海市三等奖。
1982年，为迎接第五届全国运动会在沪召开，我院承接并完成了市游泳馆的主体工程--曲线定位、28根桩柱杯型基础定位和钢结构网架总拼控制等测量。网架屋顶整体吊装工程测量分别获1986年部和市三等奖。同年完成的市重点工程--浦东煤气厂详勘，获1987年市一等奖，上海联谊大厦（上海第一幢现代化高层办公大楼，28层）工程地质详勘获1986年建设部和上海市三等奖。随后，相继完成中英合资上海耀华皮尔金顿浮法玻璃厂工程地质勘察（1984年完成，后该项目获上海市一等奖和国家银质奖），上海国际贸易中心勘察、黄浦江上游引水工程四号井降水工程（85年），上海锦昌文华大酒店勘察（86年），高化七五规划区建筑方格网测量，花园饭店变形测量（86年），上海大众汽车厂冲压车间勘察、上海明胶曝气井工程（87年），常州二五三厂深层曝气井工程（88年）。1988年，院岩土组采用挤密碎石桩成功处理金山石化总厂陈山两只5万立方浮顶油罐的地基加固；水文队在常州成功开凿直径2.5米，深43米污水处理井。
1989年，历时两年完成的市重点科研项目《浦东桩基工程地质图集编制》被评为上海市科技进步三等奖，该项目在收集和分析已有勘察、设计和施工信息的基础上，针对上海的建设特点，用图集的方式来反映编图区内的基本工程地质信息以及有关桩基工程的各有关要素，在国内首次实现了计算机辅助编制城市工程地质图集，对于开发浦东地区具有很大的意义。
1991年，承接并完成市重点工程--上海广播电视塔（东方明珠）的勘察，后该项目获上海市优秀勘察设计一等奖。同年5月，先后承接上海"八五"期间的重大市政基础设施项目内环线高架道路勘察（获市一等奖）和杨浦大桥测量监理等重大工程。
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第三阶段，1992年至2003年底
以邓小平南巡重要讲话和党的十四大的召开为重要标志，中央明确提出社会主义的经济体制改革方向是建立社会主义市场经济体制，至此，改革开放进入一个新的历史时期。这是继1990年中央提出开发开放浦东的重大决策以来，又一次给上海的发展带来了强劲的动力和巨大的机遇，上海按照"一年一个样，三年大变样"的要求，城市建设的规模和范围进一步扩大。1993年10月，我院成立35周年院庆，我院更名为上海岩土工程勘察设计研究院。
自1995年以来，按照现代企业管理的模式，我院坚持以改革为主线，以市场为导向，解放思想，转变观念，积极探索由事业单位向企业单位转化，通过试行技术承包责任制，实施技术与劳务的分离，改革分配办法，进一步深化工程勘察设计经济体制改革，转换经营机制，进一步增强活力，稳定职工队伍，提高经济效益。1996年，首次公开招聘生产经营部经理，掀开了干部制度改革的序幕，将干部制度由任命制改为聘任制；实施全员聘用合同制，建立合同契约制度，改正式工为合同制；改革分配制度，将事业单位工资制度转为档案工资，实行岗位工资制，建立收入分配能增能减新机制，逐步建立一种"上岗靠竞争，使用看实绩，奖惩凭贡献"的用人新机制。按照岩土工程管理体制来设置院的专业结构，建立"大综小专"的专业管理模式，实施专业和部门的优化设置，实现生产要素的剥离重组，以内部市场为载体，发挥专业优势和潜能，积极发展新兴技术，加快调整专业业务结构，基本形成了我院勘察、设计、测试、测量和工程承包等五大专业，提高了适应市场、占领市场的能力，增强了企业发展的空间和后劲，取得了良好的经济效益和社会效益，单位综合实力不断增强，社会信誉日益提高。全院产值、利润、人均收入稳步提高，院的积累进一步增长，综合实力日益增强，在全国万家勘察设计单位综合实力百强统计中，我院始终榜上有名；在上海市的勘察设计单位综合考评中，我院亦名列前茅，显示出我院在行业发展中的排头兵地位，成为上海乃至全国著名的综合性岩土工程勘察设计大院。
在此阶段，我院参与了几乎所有上海市重大工程建设任务，工程获奖项目也同步增加。1992年，杨浦发电厂过江顶管导向测量获国家银奖，上海市合流污水工程8、9、10号井隧道导向测量获部优二等奖，上海江西中路750号大楼岩土工程技术咨询、上海漕宝路地铁站地下管线探测、无锡市第一制药厂深层曝气槽工程获部优三等奖，合流污水3.1标导向测量获市一等奖，控江小区工程地质勘察、国际贸易中心工程地质勘察获市二等奖，常州二五三厂深层曝气井和石化总厂涤纶厂三期工程哑弹探测获市三等奖。1992年，我院被评为全国工程勘察系统先进单位，1993年，被评为全国勘察设计单位百强单位。自1995年以来共有26项工程获国家及部、市级嘉奖，其中最具代表性的有：1995年12月间，我院与日本清水建设株式会社签署合作协议，承担拟建的世界最高建筑（高460米，95层）的上海环球金融中心的工程地质勘察。在该工程中，创下了上海工程勘察史的新记录：钻探深度277.8米，进入基岩，土体弹性波速测试深度250米，地脉动测试深度达82米。1996年8月，承担"九五"国家重点项目--浦东国际机场航站楼的勘察，获上海市优秀工程二等奖和国家铜质奖；上海市内环线高架道路工程勘察获1995年上海市市优勘察一等奖；上海地铁一号线工程测量监理获1996年度上海市优秀勘察设计监理二等奖；上海世界广场勘察及基坑降水工程获1996年度市优勘察二等奖；上海金茂大厦工程勘察获1997年上海市优秀勘察设计一等奖；黄浦江上游取水二期长桥水厂顶管导向测量获1997年上海市优秀测量一等奖；张扬路商业购物中心"黄浦商厦""步行街"第七届国家优秀勘察铜奖和部优二等奖；浦东国际金融中心工程地质勘察获1999年度市优秀勘察二等奖；莘庄立交桥工程获1999年度市优测量二等奖；上海金茂大厦（88层）岩土工程勘察与检测获国家第七届优秀勘察银奖；苏州国际会议展览中心工程勘察与监测获上海市2001年度优秀勘察一等奖。
贯彻"科教兴院"的方针，坚持质量第一，于1998年，相继获得ISO9001质量体系认证证书、上海市计量认证证书。2000年获“上海市质量标兵企业”和“上海市文明单位”称号。
随着改革的不断推进，我院于2003年初告别事业单位体制，顺利改为企业。………………………………………………………………………………………………………
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第四阶段，2003年底至今
秉承多年来企业深化改革、加快发展成果，我院于2003年底胜利完成改制任务，更名为上海岩土工程勘察设计研究院有限公司。国有资本从我院全部退出，新公司注册资本800万元，由公司主要经营者、经营者群体、主要骨干出资认股，组建民营性质的新公司，这是上海市首家市管企业改制为民营企业。新公司按照《公司法》要求和企业《章程》，构建股东会、董事会、监事会及总经理班子等较为规范的法人治理结构，积极探索民营体制下新的运行机制，继续深化改革，完成了下属子公司的改制任务，使下属设计、监理、施工及钻探公司成为面向市场竞争的法人实体。新公司坚持以改革为主线，以发展为第一要务，坚持“科技进步”和“以人为本”的原则，全面走向市场，参与市场竞争，充分利用各方资源，努力做大、做强主业，取得了良好的成绩，实现了平稳过渡、持续发展的目标，显示出企业强劲的发展势头。
公司制定了“五年发展规划纲要”，提出了公司发展的战略目标是：“坚持创新，加快发展，依托品牌，整合资源，做强主业，适度多元，建成人才集聚、机制灵活、管理优化、文化先进的岩土工程（咨询）公司，成为行业中最有发展前景的企业。”明确了企业发展的定位为岩土工程（咨询）公司，经过五年努力，构建起以提升技术核心竞争力为目标的技术创新体系、以资源充分配置为基础品牌经营为核心的技术经营一体化的市场扩张体系、岩土工程一体化专业联动发展的产业体系、公平竞争规范有序的人力资源管理体系、科学决策运作高效的组织管理体系、以人为本和谐发展的文化建设体系，使公司成为具有投资决策中心、技术发展中心、品牌维护中心、人才集聚中心、信息交流中心、文化建设中心等综合功能的现代企业。
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